Научно-исследовательская работа студентов физического факультета активно ведется на каждой кафедре. Итогом работы являются внутри- и межвузовские олимпиады и конференции, а также различного уровня конференции, симпозиумы, школы.
Ежегодно кафедра теоретической физики проводится с участием студентов Международную Байкальскую летнюю школу по физике элементарных частиц и астрофизике в п. Большие Коты Иркутской области при поддержке РФФИ, фонда «Династия» и Министерства образования и науки РФ. Руководитель школы к.ф.-м.н. С.В. Ловцов.
Проходят научные семинары и школы по лазерной физике (кафедра общей физики и Иркутский филиал Института лазерной физики СО РАН), руководитель д.ф.-м.н. Е.Ф. Мартынович.
Особая роль в организации НИРС на факультете отводится лабораториям НИИ Прикладной физики ИГУ:
- лаборатория астрофизики элементарных частиц и гамма астрофизики (студенты выезжают на практику в Тункинский астрофизический центр коллективного пользования и в Байкальскую нейтринную обсерваторию, руководитель д.ф.-м.н. Н.М. Буднев).
В институтах СО РАН студенты не только выполняют курсовые и дипломные работы, но и физические практикумы.